طبع زيره سياه خيلي گرم و خشک است. زيره سياه دارای خواص مدر، بادشکن، مقوي، زيادکننده شير، قاعده‌آور، نيرودهنده، ضد کرم، هضم کننده، ضد تشنج، قابض، معرق، مقوی معده، قاطع اسپرم است.
زيره سياه در بلع هوا، نفخ شکم، برطرف کردن سوءهاضمه، تسهيل هضم غذا، دل پيچه کودکان، انگل معده و روده، دفع بادهاي کليه و مثانه، تنگي نفس، خفقان سرد، سکسکه نفخی به‌کار می‌رود. زيره سیاه يک داروي سنتی براي رفع سوءهاضمه خصوصاً نفخ شکم است